HBeAg deb qisqartirilgan gepatit BE antijeni gepatit B virusining asosiy zarralarida eriydigan oqsildir. Umuman olganda, HBeAg HBcAg ichiga ko'milgan. HBcAg parchalanganda, HBeAg jigar yadrosidan qon zardobida eriydi, HBsAg dan kechroq paydo bo'ladi va HBsAg dan erta yo'qoladi. Shuning uchun bu HBV bilan inson infektsiyasidan keyin HBsAg bilan paydo bo'ladigan ikkinchi serologik antigen markerdir. HBeAg o'tkir gepatitning vaqtinchalik o'sishini ko'rsatadi, bu ALT ko'tarilishidan oldin inkubatsiya davrida paydo bo'ladi va keyin butunlay yo'qolgunga qadar vaziyatning yaxshilanishi bilan tez pasayadi. Gepatit B ning faol bosqichida HBeAg ni aniqlash darajasi oshdi, bu jigar hujayralarining jiddiy shikastlanganligini va bemorlarning juda yuqumli ekanligini ko'rsatadi.
